La tranquila vida de X se tambalea cuando aparece un siniestro personaje que destroza su hogar y dice actuar en nombre del misterioso creador, un ser supremo que planea destruir su mundo. Decidida a evitarlo cueste lo que cueste, X acepta la ayuda del pájaro F:El para desentrañar el misterio e intentar impedir que ese misterioso creador lo destruya todo.